在《命运石之门第二季》中，主人公冈部伦太郎经历了超过人类想象的苦难，跨越了尽头悲哀的放弃了挽救“她”的世界线的惨痛故事。他失去的不仅仅是那个“她”，还有他自己的心灵深处。在被“封印”的“凤凰院凶真”面前，他无助地瑟缩着，仿佛整个世界都在他的肩上。他担心着他的伙伴们，不知道他们是否还会与他并肩作战。突然间，新登场的角色们出现了，他们也在这个充满阴谋和未知的世界里漂泊。他们都有各自的命运，临危受命来到了这里。但是，未被拯救的“她”到底怎么了呢？她现在也在《STEINS；GATE》中那个没登场的角色的身边，他们即将迎来被描绘的“0”的故事。所有的一切都充满着神秘和未知，令人热血沸腾。g